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Rodriguez, AlejandroAutor (correspondencia)Gomez, JosepAutor o CoautorGomez-Bertomeu, FredericAutor o CoautorBodi, MariaAutor o Coautor

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12 de noviembre de 2024
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Artículo
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A Machine Learning Approach to Determine Risk Factors for Respiratory Bacterial/Fungal Coinfection in Critically Ill Patients with Influenza and SARS-CoV-2 Infection: A Spanish Perspective

Publicado en:Antibiotics. 13 (10): 968- - 2024-10-01 13(10), DOI: 10.3390/antibiotics13100968

Autores: Rodriguez, Alejandro; Gomez, Josep; Martin-Loeches, Ignacio; Claverias, Laura; Diaz, Emili; Zaragoza, Rafael; Borges-Sa, Marcio; Gomez-Bertomeu, Frederic; Franquet, Alvaro; Trefler, Sandra; Garzon, Carlos Gonzalez; Cortes, Lissett; Ales, Florencia; Sancho, Susana; Sole-Violan, Jordi; Estella, Angel; Berrueta, Julen; Garcia-Martinez, Alejandro; Suberviola, Borja; Guardiola, Juan J; Bodi, Maria

Afiliaciones

Clin Med Dr Alejandro Gutierrez, Dept Invest, S2600, Venado Tuerto, Argentina - Autor o Coautor
Ctr Biomed Res Infect Dis Network CIBERINFEC, Madrid 28220, Spain - Autor o Coautor
Ctr Biomed Res Network Resp Dis CIBERES, Tarragona 43005, Spain - Autor o Coautor
Dr Peset Univ Hosp, Anesthesiol & Crit Care Dept, Valencia 46017, Spain - Autor o Coautor
Fdn Univ Ciencias Salud, Fac Med, Postgrad Med Crit & Cuidado Intens, Cra 54 67A-80, Bogota 111221, Colombia - Autor o Coautor
Hosp Dr Negrin, Dept Pathol, Las Palmas Gran Canaria, Spain - Autor o Coautor
Hosp Son Llatzer, Crit Care Dept, Palma De Mallorca 07198, Spain - Autor o Coautor
Hosp Univ & Politecn La Fe, Crit Care Dept, Valencia 46026, Spain - Autor o Coautor
Hosp Univ Joan XXIII, Crit Care Dept, Tarragona 43005, Spain - Autor o Coautor
Hosp Univ Joan XXIII, Tech Secretarys Dept, Tarragona 43005, Spain - Autor o Coautor
Hosp Univ Marques de Valdecilla, Crit Care Dept, Santander 39008, Spain - Autor o Coautor
Hosp Univ Parc Tauli, Crit Care Dept, Parc Tauli 1, Sabadell 08208, Spain - Autor o Coautor
Hosp Univ Tarragona Joan XXIII, Microbiol Clin Anal Lab, Tarragona 43005, Spain - Autor o Coautor
Pere Virgili Hlth Res Inst, Tarragona 43005, Spain - Autor o Coautor
St James Hospita, Multidisciplinary Intens Care Res Org MICRO, Dept Intens Care Med, Dublin D08 NHY1, Ireland - Autor o Coautor
Tarragona Hlth Data Res Working Grp THeDaR, Tarragona 43005, Spain - Autor o Coautor
Univ Autonoma Barcelona, Fac Med, E-08193 Bellaterra, Spain - Autor o Coautor
Univ Cadiz, Fac Med, Jerez de la Frontera, Spain - Autor o Coautor
Univ Hosp Jerez, Crit Care Med Unit, INIBiCA, Jerez de la Frontera 11407, Spain - Autor o Coautor
Univ Louisville, Robley Rex VA Med Ctr, Louisville, KY 40202 USA - Autor o Coautor
Univ Rovira & Virgili, Fac Med, Tarragona 43005, Spain - Autor o Coautor
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Resumen

Background: Bacterial/fungal coinfections (COIs) are associated with antibiotic overuse, poor outcomes such as prolonged ICU stay, and increased mortality. Our aim was to develop machine learning-based predictive models to identify respiratory bacterial or fungal coinfections upon ICU admission. Methods: We conducted a secondary analysis of two prospective multicenter cohort studies with confirmed influenza A (H1N1)pdm09 and COVID-19. Multiple logistic regression (MLR) and random forest (RF) were used to identify factors associated with BFC in the overall population and in each subgroup (influenza and COVID-19). The performance of these models was assessed by the area under the ROC curve (AUC) and out-of-bag (OOB) methods for MLR and RF, respectively. Results: Of the 8902 patients, 41.6% had influenza and 58.4% had SARS-CoV-2 infection. The median age was 60 years, 66% were male, and the crude ICU mortality was 25%. BFC was observed in 14.2% of patients. Overall, the predictive models showed modest performances, with an AUC of 0.68 (MLR) and OOB 36.9% (RF). Specific models did not show improved performance. However, age, procalcitonin, CRP, APACHE II, SOFA, and shock were factors associated with BFC in most models. Conclusions: Machine learning models do not adequately predict the presence of co-infection in critically ill patients with pandemic virus infection. However, the presence of factors such as advanced age, elevated procalcitonin or CPR, and high severity of illness should alert clinicians to the need to rule out this complication on admission to the ICU.

Palabras clave

Bacterial coinfectionCovid-19Fungal coinfectionInfluenza a (h1n1)Machine learninMachine learning

Indicios de calidad

Impacto bibliométrico. Análisis de la aportación y canal de difusión

El trabajo ha sido publicado en la revista Antibiotics debido a la progresión y el buen impacto que ha alcanzado en los últimos años, según la agencia WoS (JCR), se ha convertido en una referencia en su campo. En el año de publicación del trabajo, 2024 aún no existen indicios calculados, pero en 2023, se encontraba en la posición 26/132, consiguiendo con ello situarse como revista Q1 (Primer Cuartil), en la categoría Infectious Diseases.

Impacto y visibilidad social

Desde la dimensión de Influencia o adopción social, y tomando como base las métricas asociadas a las menciones e interacciones proporcionadas por agencias especializadas en el cálculo de las denominadas “Métricas Alternativas o Sociales”, podemos destacar a fecha 2025-07-17:

  • La utilización de esta aportación en marcadores, bifurcaciones de código, añadidos a listas de favoritos para una lectura recurrente, así como visualizaciones generales, indica que alguien está usando la publicación como base de su trabajo actual. Esto puede ser un indicador destacado de futuras citas más formales y académicas. Tal afirmación es avalada por el resultado del indicador “Capture” que arroja un total de: 13 (PlumX).

Con una intencionalidad más de divulgación y orientada a audiencias más generales podemos observar otras puntuaciones más globales como:

    Es fundamental presentar evidencias que respalden la plena alineación con los principios y directrices institucionales en torno a la Ciencia Abierta y la Conservación y Difusión del Patrimonio Intelectual. Un claro ejemplo de ello es:

    • El trabajo se ha enviado a una revista cuya política editorial permite la publicación en abierto Open Access.
    • Asignación de un Handle/URN como identificador dentro del Depósito en el Repositorio Institucional: http://hdl.handle.net/20.500.11797/imarina9390033

    Análisis de liderazgo de los autores institucionales

    Este trabajo se ha realizado con colaboración internacional, concretamente con investigadores de: Argentina; Colombia; United Kingdom; United States of America.

    Existe un liderazgo significativo ya que algunos de los autores pertenecientes a la institución aparecen como primer o último firmante, se puede apreciar en el detalle: Primer Autor (Rodríguez Oviedo, Alejandro Hugo) y Último Autor (Bodi Saera, Maria Amparo).

    el autor responsable de establecer las labores de correspondencia ha sido Rodríguez Oviedo, Alejandro Hugo.