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Emergence of Assortative Mixing between Clusters of Cultured Neurons

Publicado en:Plos Computational Biology. 10 (9): e1003796-e1003796 - 2014-09-01 10(9), DOI: 10.1371/journal.pcbi.1003796

Autores: Teller, Sara; Granell, Clara; De Domenico, Manlio; Soriano, Jordi; Gomez, Sergio; Arenas, Alex

Afiliaciones

Univ Barcelona, Dept Estruct & Constituents Materia, Barcelona, Spain - Autor o Coautor
Univ Rovira & Virgili, Dept Engn Informat & Matemat, E-43007 Tarragona, Spain - Autor o Coautor
Universitat de Barcelona - Autor o Coautor
Universitat Rovira i Virgili - Autor o Coautor

Resumen

© 2014 Teller et al. The analysis of the activity of neuronal cultures is considered to be a good proxy of the functional connectivity of in vivo neuronal tissues. Thus, the functional complex network inferred from activity patterns is a promising way to unravel the interplay between structure and functionality of neuronal systems. Here, we monitor the spontaneous self-sustained dynamics in neuronal cultures formed by interconnected aggregates of neurons (clusters). Dynamics is characterized by the fast activation of groups of clusters in sequences termed bursts. The analysis of the time delays between clusters' activations within the bursts allows the reconstruction of the directed functional connectivity of the network. We propose a method to statistically infer this connectivity and analyze the resulting properties of the associated complex networks. Surprisingly enough, in contrast to what has been reported for many biological networks, the clustered neuronal cultures present assortative mixing connectivity values, meaning that there is a preference for clusters to link to other clusters that share similar functional connectivity, as well as a rich-club core, which shapes a ‘connectivity backbone’ in the network. These results point out that the grouping of neurons and the assortative connectivity between clusters are intrinsic survival mechanisms of the culture.

Palabras clave

Astronomia / físicaBiochemical research methodsBiodiversidadeBiotecnologíaCellular and molecular neuroscienceCiência da computaçãoCiências agrárias iCiências biológicas iCiências biológicas iiComputational theory and mathematicsEcologyEcology, evolution, behavior and systematicsEngenharias iiiEngenharias ivEnsinoGeneticsInterdisciplinarMatemática / probabilidade e estatísticaMathematical & computational biologyMathematics, interdisciplinary applicationsMedicina iMedicina iiModeling and simulationMolecular biologyPsicologíaSaúde coletiva

Indicios de calidad

Impacto bibliométrico. Análisis de la aportación y canal de difusión

El trabajo ha sido publicado en la revista Plos Computational Biology debido a la progresión y el buen impacto que ha alcanzado en los últimos años, según la agencia WoS (JCR), se ha convertido en una referencia en su campo. En el año de publicación del trabajo, 2014, se encontraba en la posición 4/57, consiguiendo con ello situarse como revista Q1 (Primer Cuartil), en la categoría Mathematical & Computational Biology.

Desde una perspectiva relativa, y atendiendo al indicador del impacto normalizado calculado a partir de las Citas Mundiales proporcionadas por WoS (ESI, Clarivate), arroja un valor para la normalización de citas relativas a la tasa de citación esperada de: 1.36. Esto indica que, de manera comparada con trabajos en la misma disciplina y en el mismo año de publicación, lo ubica como trabajo citado por encima de la media. (fuente consultada: ESI 14 Nov 2024)

Esta información viene reforzada por otros indicadores del mismo tipo, que aunque dinámicos en el tiempo y dependientes del conjunto de citaciones medias mundiales en el momento de su cálculo, coinciden en posicionar en algún momento al trabajo, entre el 50% más citados dentro de su temática:

  • Media Ponderada del Impacto Normalizado de la agencia Scopus: 1.78 (fuente consultada: FECYT Feb 2024)
  • Field Citation Ratio (FCR) de la fuente Dimensions: 10.84 (fuente consultada: Dimensions Jun 2025)

De manera concreta y atendiendo a las diferentes agencias de indexación, el trabajo ha acumulado, hasta la fecha 2025-06-23, el siguiente número de citas:

  • WoS: 53
  • Scopus: 54
  • Europe PMC: 26
  • Google Scholar: 84
  • Open Alex: 67
  • OpenCitations: 59

Impacto y visibilidad social

Desde la dimensión de Influencia o adopción social, y tomando como base las métricas asociadas a las menciones e interacciones proporcionadas por agencias especializadas en el cálculo de las denominadas “Métricas Alternativas o Sociales”, podemos destacar a fecha 2025-06-23:

  • El uso, desde el ámbito académico evidenciado por el indicador de la agencia Altmetric referido como agregaciones realizadas por el gestor bibliográfico personal Mendeley, nos da un total de: 115.
  • La utilización de esta aportación en marcadores, bifurcaciones de código, añadidos a listas de favoritos para una lectura recurrente, así como visualizaciones generales, indica que alguien está usando la publicación como base de su trabajo actual. Esto puede ser un indicador destacado de futuras citas más formales y académicas. Tal afirmación es avalada por el resultado del indicador “Capture” que arroja un total de: 115 (PlumX).

Con una intencionalidad más de divulgación y orientada a audiencias más generales podemos observar otras puntuaciones más globales como:

  • El Score total de Altmetric: 8.85.
  • El número de menciones en la red social X (antes Twitter): 13 (Altmetric).

Es fundamental presentar evidencias que respalden la plena alineación con los principios y directrices institucionales en torno a la Ciencia Abierta y la Conservación y Difusión del Patrimonio Intelectual. Un claro ejemplo de ello es:

  • El trabajo se ha enviado a una revista cuya política editorial permite la publicación en abierto Open Access.

Análisis de liderazgo de los autores institucionales

Existe un liderazgo significativo ya que algunos de los autores pertenecientes a la institución aparecen como primer o último firmante, se puede apreciar en el detalle: Último Autor (Arenas A).