Publicacions
>
Article

Emergence of Assortative Mixing between Clusters of Cultured Neurons

Publicat a:Plos Computational Biology. 10 (9): e1003796-e1003796 - 2014-09-01 10(9), DOI: 10.1371/journal.pcbi.1003796

Autors: Teller, Sara; Granell, Clara; De Domenico, Manlio; Soriano, Jordi; Gomez, Sergio; Arenas, Alex

Afiliacions

Univ Barcelona, Dept Estruct & Constituents Materia, Barcelona, Spain - Autor o coautor
Univ Rovira & Virgili, Dept Engn Informat & Matemat, E-43007 Tarragona, Spain - Autor o coautor
Universitat de Barcelona - Autor o coautor
Universitat Rovira i Virgili - Autor o coautor

Resum

© 2014 Teller et al. The analysis of the activity of neuronal cultures is considered to be a good proxy of the functional connectivity of in vivo neuronal tissues. Thus, the functional complex network inferred from activity patterns is a promising way to unravel the interplay between structure and functionality of neuronal systems. Here, we monitor the spontaneous self-sustained dynamics in neuronal cultures formed by interconnected aggregates of neurons (clusters). Dynamics is characterized by the fast activation of groups of clusters in sequences termed bursts. The analysis of the time delays between clusters' activations within the bursts allows the reconstruction of the directed functional connectivity of the network. We propose a method to statistically infer this connectivity and analyze the resulting properties of the associated complex networks. Surprisingly enough, in contrast to what has been reported for many biological networks, the clustered neuronal cultures present assortative mixing connectivity values, meaning that there is a preference for clusters to link to other clusters that share similar functional connectivity, as well as a rich-club core, which shapes a ‘connectivity backbone’ in the network. These results point out that the grouping of neurons and the assortative connectivity between clusters are intrinsic survival mechanisms of the culture.

Paraules clau

Astronomia / físicaBiochemical research methodsBiodiversidadeBiotecnologíaCellular and molecular neuroscienceCiência da computaçãoCiências agrárias iCiências biológicas iCiências biológicas iiComputational theory and mathematicsEcologyEcology, evolution, behavior and systematicsEngenharias iiiEngenharias ivEnsinoGeneticsInterdisciplinarMatemática / probabilidade e estatísticaMathematical & computational biologyMathematics, interdisciplinary applicationsMedicina iMedicina iiModeling and simulationMolecular biologyPsicologíaSaúde coletiva

Indicis de qualitat

Impacte bibliomètric. Anàlisi de la contribució i canal de difusió

El treball ha estat publicat a la revista Plos Computational Biology a causa de la seva progressió i el bon impacte que ha aconseguit en els últims anys, segons l'agència WoS (JCR), s'ha convertit en una referència en el seu camp. A l'any de publicació del treball, 2014, es trobava a la posició 4/57, aconseguint així situar-se com a revista Q1 (Primer Cuartil), en la categoria Mathematical & Computational Biology.

Des d'una perspectiva relativa, i tenint en compte l'indicador de impacte normalitzat calculat a partir de les Citacions Mundials proporcionades per WoS (ESI, Clarivate), proporciona un valor per a la normalització de citacions relatives a la taxa de citació esperada de: 1.36. Això indica que, comparat amb treballs en la mateixa disciplina i en el mateix any de publicació, el situa com un treball citat per sobre de la mitjana. (font consultada: ESI 14 Nov 2024)

Aquesta informació es reforça amb altres indicadors del mateix tipus, que encara que dinàmics en el temps i dependents del conjunt de citacions mitjanes mundials en el moment del seu càlcul, coincideixen a posicionar en algun moment el treball, entre el 50% més citats dins de la seva temàtica:

  • Mitjana Ponderada de l'Impacte Normalitzat de l'agència Scopus: 1.78 (font consultada: FECYT Febr 2024)
  • Field Citation Ratio (FCR) de la font Dimensions: 10.84 (font consultada: Dimensions Jun 2025)

Concretament, i atenent a les diferents agències d'indexació, aquest treball ha acumulat, fins a la data 2025-06-23, el següent nombre de cites:

  • WoS: 53
  • Scopus: 54
  • Europe PMC: 26
  • Google Scholar: 84
  • Open Alex: 67
  • OpenCitations: 59

Impacte i visibilitat social

Des de la dimensió d'influència o adopció social, i prenent com a base les mètriques associades a les mencions i interaccions proporcionades per agències especialitzades en el càlcul de les denominades "Mètriques Alternatives o Socials", podem destacar a data 2025-06-23:

  • L'ús, des de l'àmbit acadèmic evidenciat per l'indicador de l'agència Altmetric referit com a agregacions realitzades pel gestor bibliogràfic personal Mendeley, ens dona un total de: 115.
  • L'ús d'aquesta aportació en marcadors, bifurcacions de codi, afegits a llistes de favorits per a una lectura recurrent, així com visualitzacions generals, indica que algú està fent servir la publicació com a base del seu treball actual. Això pot ser un indicador destacat de futures cites més formals i acadèmiques. Aquesta afirmació està avalada pel resultat de l'indicador "Capture", que aporta un total de: 115 (PlumX).

Amb una intenció més de divulgació i orientada a audiències més generals, podem observar altres puntuacions més globals com:

  • El Puntuació total de Altmetric: 8.85.
  • El nombre de mencions a la xarxa social X (abans Twitter): 13 (Altmetric).

És fonamental presentar evidències que recolzin l'alineació plena amb els principis i directrius institucionals sobre Ciència Oberta i la Conservació i Difusió del Patrimoni Intel·lectual. Un clar exemple d'això és:

  • El treball s'ha enviat a una revista la política editorial de la qual permet la publicació en obert Open Access.

Anàlisi del lideratge dels autors institucionals

Hi ha un lideratge significatiu, ja que alguns dels autors pertanyents a la institució apareixen com a primer o últim signant, es pot apreciar en el detall: Últim Autor (Arenas A).