{rfName}
On

Indexat a

Llicència i ús

Icono OpenAccess

Citacions

73

Altmetrics

Grant support

This work was funded through King Abdulaziz University, under the financing of the collaborative project Selection and application of aptamers against anabolic steroids.

Anàlisi d'autories institucional

Botero Gallego, Mary LuzAutor o coautorSkouridou, VasoulaAutor o coautorAktas, GÜlsen BetÜlAutor o coautorJauset-Rubio, MiriamAutor o coautorSvobodová, MarkétaAutor o coautorO'Sullivan, Ciara K.Autor o coautor

Compartir

30 dedesembre de 2019
Publicacions
>
Article
Sí

One-Pot SELEX: Identification of Specific Aptamers against Diverse Steroid Targets in One Selection

Publicat a:Acs Omega. 4 (23): 20188-20196 - 2019-12-03 4(23), DOI: 10.1021/acsomega.9b02412

Autors: Jauset-Rubio, Miriam; Luz Botero, Mary; Skouridou, Vasso; Betul Aktas, Gulsen; Svobodova, Marketa; Bashammakh, Abdulaziz S; El-Shahawi, Mohammad S; Alyoubi, Abdulrahman O; O'Sullivan, Ciara K

Afiliacions

ICREA, Passeig Lluis Companys 23, Barcelona 08010, Spain - Autor o coautor
King Abdulaziz Univ, Fac Sci, Dept Chem, POB 80203, Jeddah 21589, Saudi Arabia - Autor o coautor
Univ Rovira & Virgili, Dept Engn Quim, INTERFIBIO Res Grp, Avinguda Paisos Catalans 26, E-43007 Tarragona, Spain - Autor o coautor

Resum

Aptamers are well-established biorecognition molecules used in a wide variety of applications for the detection of their respective targets. However, individual SELEX processes typically performed for the identification of aptamers for each target can be quite time-consuming, labor-intensive, and costly. An alternative strategy is proposed herein for the simultaneous identification of different aptamers binding distinct but structurally similar targets in one single selection. This one-pot SELEX approach, using the steroids estradiol, progesterone, and testosterone as model targets, was achieved by combining the benefits of counter-SELEX with the power of next-generation sequencing and bioinformatics analysis. The pools from the last stage of the selection were compared in order to discover sequences with preferential abundance in only one of the pools. This led to the identification of aptamer candidates with potential specificity to a single steroid target. Binding studies demonstrated the high affinity of each selected aptamer for its respective target, and low nanomolar range dissociation constants calculated were similar to those previously reported for steroid-binding aptamers selected using traditional SELEX approaches. Finally, the selected aptamers were exploited in microtiter plate assays, achieving nanomolar limits of detection, while the specificity of these aptamers was also demonstrated. Overall, the one-pot SELEX strategy led to the discovery of aptamers for three different steroid targets in one single selection without compromising their affinity or specificity, demonstrating the power of this approach of aptamer discovery for the simultaneous selection of aptamers against multiple targets.

Paraules clau

Dna aptamerEvolutionIn-vitro selectionLigandsProgesterone

Indicis de qualitat

Impacte bibliomètric. Anàlisi de la contribució i canal de difusió

El treball ha estat publicat a la revista Acs Omega a causa de la seva progressió i el bon impacte que ha aconseguit en els últims anys, segons l'agència Scopus (SJR), s'ha convertit en una referència en el seu camp. A l'any de publicació del treball, 2019, es trobava a la posició , aconseguint així situar-se com a revista Q1 (Primer Cuartil), en la categoria Chemical Engineering (Miscellaneous).

Des d'una perspectiva relativa, i atenent a l'indicador de impacte normalitzat calculat a partir de les Citacions Mundials de Scopus Elsevier, proporciona un valor per a la mitjana Ponderada de l'Impacte Normalitzat de l'agència Scopus: 1.35, el que indica que, comparat amb treballs en la mateixa disciplina i en el mateix any de publicació, el situa com un treball citat per sobre de la mitjana. (font consultada: ESI 14 Nov 2024)

Aquesta informació es reforça amb altres indicadors del mateix tipus, que encara que dinàmics en el temps i dependents del conjunt de citacions mitjanes mundials en el moment del seu càlcul, coincideixen a posicionar en algun moment el treball, entre el 50% més citats dins de la seva temàtica:

  • Field Citation Ratio (FCR) de la font Dimensions: 3.51 (font consultada: Dimensions Jul 2025)

Concretament, i atenent a les diferents agències d'indexació, aquest treball ha acumulat, fins a la data 2025-07-16, el següent nombre de cites:

  • WoS: 30
  • Scopus: 33
  • Europe PMC: 7

Impacte i visibilitat social

Des de la dimensió d'influència o adopció social, i prenent com a base les mètriques associades a les mencions i interaccions proporcionades per agències especialitzades en el càlcul de les denominades "Mètriques Alternatives o Socials", podem destacar a data 2025-07-16:

  • L'ús, des de l'àmbit acadèmic evidenciat per l'indicador de l'agència Altmetric referit com a agregacions realitzades pel gestor bibliogràfic personal Mendeley, ens dona un total de: 71.
  • L'ús d'aquesta aportació en marcadors, bifurcacions de codi, afegits a llistes de favorits per a una lectura recurrent, així com visualitzacions generals, indica que algú està fent servir la publicació com a base del seu treball actual. Això pot ser un indicador destacat de futures cites més formals i acadèmiques. Aquesta afirmació està avalada pel resultat de l'indicador "Capture", que aporta un total de: 76 (PlumX).

Amb una intenció més de divulgació i orientada a audiències més generals, podem observar altres puntuacions més globals com:

  • El Puntuació total de Altmetric: 6.

És fonamental presentar evidències que recolzin l'alineació plena amb els principis i directrius institucionals sobre Ciència Oberta i la Conservació i Difusió del Patrimoni Intel·lectual. Un clar exemple d'això és:

  • El treball s'ha enviat a una revista la política editorial de la qual permet la publicació en obert Open Access.
  • Assignació d'un Handle/URN com a identificador dins del Dipòsit en el Repositori Institucional: http://hdl.handle.net/20.500.11797/imarina6012540

Anàlisi del lideratge dels autors institucionals

Aquest treball s'ha realitzat amb col·laboració internacional, concretament amb investigadors de: Saudi Arabia.

Hi ha un lideratge significatiu, ja que alguns dels autors pertanyents a la institució apareixen com a primer o últim signant, es pot apreciar en el detall: Primer Autor (Jauset Rubio, Miriam) i Últim Autor (O'SULLIVAN, CIARA KATHLEEN).