{rfName}

Llicència i ús

Icono OpenAccess

Altmetrics

Grant support

This research was funded by the projects JPIW2013-095-C03-03 of MINECO (Spain), AQUAVALENS of the Seventh Framework Program (FP7/2007-2013) from the European Union, as well as the CONACYT project CB-2008-01-103142 (UAEM1900/2010C) and Secretaria de Investigacion y Postgrado (SIP-IPN) project 20211351, 20220818. OACM received grant-aided support from "Consejo Nacional de Ciencia y Tecnologia" (CONACyT, Mexico). GCE received support from the "Sistema Nacional de Investigadores" (SNI) from CONACyT, Mexico, Estimulo al Desempeno en Investigacion and Comision y Fomento de Actividades Academicas (Instituto Politecnico Nacional).

Impacte en els Objectius de Desenvolupament Sostenible (ODS)

Anàlisi d'autories institucional

Fernandez-Bravo, AnaAutor o coautorFernández Bravo, AnaAutor o coautorPérez-Cataluña, AlbaAutor o coautorBeaz-Hidalgo, RoxanaAutor o coautorJose Figueras, MariaAutor (correspondència)

Compartir

28 denovembre de 2022
Publicacions
>
Article

First Record of the Rare Species Aeromonas lusitana from Rainbow Trout (Oncorhynchus mykiss, Walbaum): Comparative Analysis with the Existing Strains

Publicat a:Pathogens. 11 (11): 1299-1299 - 2022-11-01 11(11), DOI: 10.3390/pathogens11111299

Autors: Fernandez-Bravo, Ana; Vega-Sanchez, Vicente; Perez-Cataluna, Alba; Latif-Eugenin, Fadua; Beaz-Hidalgo, Roxana; Martinez-Murcia, Antonio; Soriano-Vargas, Edgardo; Alejandro Cabrero-Martinez, Omar; Castro-Escarpulli, Graciela; Jose Figueras, Maria;

Afiliacions

Inst Politecn Nacl IPN, Lab Invest Clin & Ambiental, Escuela Nacl Ciencias Biol ENCB, Mexico City 11350, DF, Mexico - Autor o coautor
Univ Autonoma Estado Hidalgo, Inst Ciencias Agr, Tulancingo 43600, Mexico - Autor o coautor
Univ Autonoma Estado Mexico, Fac Med Vet & Zootecnia, Ctr Invest & Estudios Avanzados Salud Anim, Toluca 50295, Mexico - Autor o coautor
Univ Miguel Hernandez, EPSO, Area Microbiol, Orihuela 03300, Spain - Autor o coautor
Univ Rovira & Virgili, Fac Med & Ciencies Salut, Dept Ciences Med Basiques, Unitat Microbiol,IISPV, E-43201 Reus, Spain - Autor o coautor
Veure més

Resum

The species Aeromonas lusitana was first described in 2016 with five strains recovered from untreated water and vegetables from Portugal. Since then, no further records exist of this species. During a surveillance study on the presence of Aeromonas in fish farms in Mexico, a new strain (ESV351) of the mentioned species isolated from a rainbow trout was recovered. It was identified because it clustered phylogenetically with the type strain of A. lusitana based on the analysis of the ipoD gene sequences. In the present study, phenotypic characteristics, antimicrobial resistance profiles, and the presence of putative virulence genes of this novel strain (ESV-351) were determined in parallel to the five isolates from the original species description. Phenotypic differential characteristics exhibited by A. lusitana ESV-351 depicted an evident similarity to the characteristics exhibited by the other evaluated strains. However, the novel strain was positive for the production of indole using conventional methods, while the rest of the strains, including the type strain, were negative for its production. Furthermore, intermediate resistance to ampicillin, amoxicillin-clavulanic acid and cephalothin was detected in both the novel and the type strain. Five different virulence-related genes were detected in the novel strain and in the previously described strains, with the type strain exhibiting the highest number of virulence-related genes. In addition to this, the genome of the novel strain (ESV-351) was sequenced and compared with the genomes from the type strain (A. lusitana CECT 7828(T)) and other Aeromonas spp. The genomic analysis defined Aeromonas tecta as the closest species to A. lusitana with a highly similar number of predicted proteins. The genomic size, the number of protein-encoding genes and the number of different tRNAs, among other characteristics, make it possible to propose that the ESV-351 strain could potentially have the capacity to adapt to different environments. Genome comparison of the ESV-351 strain with the type strain revealed that both possess a similar sequence of the citrate synthase gene. In addition to this finding, the chromosomal region containing the citrate synthase locus of the novel strain exhibits some similarity to the chromosomal region in the genome of the A. hydrophila type strain and other known human pathogens, such as Vibrio cholerae. This could suggest a possible virulence role for the citrate synthase gene in A. lusitana (ESV-351).

Paraules clau

Aeromonas lusitanaAniCitrate synthaseCore genomesDiversityEscherichia-coliGenome sequenceGenus aeromonasIdentificationIsddhLife below waterSalmonicidaSp nov.Spp.TaxonomyVirulence genes

Indicis de qualitat

Impacte bibliomètric. Anàlisi de la contribució i canal de difusió

El treball ha estat publicat a la revista Pathogens a causa de la seva progressió i el bon impacte que ha aconseguit en els últims anys, segons l'agència WoS (JCR), s'ha convertit en una referència en el seu camp. A l'any de publicació del treball, 2022, es trobava a la posició 62/135, aconseguint així situar-se com a revista Q2 (Segundo Cuartil), en la categoria Microbiology. Destacable, igualment, el fet que la revista està posicionada en el Cuartil Q2 para la agencia Scopus (SJR) en la categoría Immunology and Microbiology (Miscellaneous).

Independentment de l'impacte esperat determinat pel canal de difusió, és important destacar l'impacte real observat de la pròpia aportació.

Segons les diferents agències d'indexació, el nombre de citacions acumulades per aquesta publicació fins a la data 2025-10-21:

  • Open Alex: 1
  • Google Scholar: 1
  • Scopus: 1
  • Europe PMC: 1

Impacte i visibilitat social

Des de la dimensió d'influència o adopció social, i prenent com a base les mètriques associades a les mencions i interaccions proporcionades per agències especialitzades en el càlcul de les denominades "Mètriques Alternatives o Socials", podem destacar a data 2025-10-21:

  • L'ús, des de l'àmbit acadèmic evidenciat per l'indicador de l'agència Altmetric referit com a agregacions realitzades pel gestor bibliogràfic personal Mendeley, ens dona un total de: 10.
  • L'ús d'aquesta aportació en marcadors, bifurcacions de codi, afegits a llistes de favorits per a una lectura recurrent, així com visualitzacions generals, indica que algú està fent servir la publicació com a base del seu treball actual. Això pot ser un indicador destacat de futures cites més formals i acadèmiques. Aquesta afirmació està avalada pel resultat de l'indicador "Capture", que aporta un total de: 14 (PlumX).

Amb una intenció més de divulgació i orientada a audiències més generals, podem observar altres puntuacions més globals com:

  • El Puntuació total de Altmetric: 0.5.
  • El nombre de mencions a la xarxa social X (abans Twitter): 1 (Altmetric).

És fonamental presentar evidències que recolzin l'alineació plena amb els principis i directrius institucionals sobre Ciència Oberta i la Conservació i Difusió del Patrimoni Intel·lectual. Un clar exemple d'això és:

  • El treball s'ha enviat a una revista la política editorial de la qual permet la publicació en obert Open Access.
  • Assignació d'un Handle/URN com a identificador dins del Dipòsit en el Repositori Institucional: http://hdl.handle.net/20.500.11797/imarina9286946
Seguint amb l'impacte social del treball, és important destacar el fet que, pel seu contingut, pot ser assignat a la línia d'interès de ODS 14 - Life below water, amb una probabilitat del 71% segons l'algoritme mBERT desenvolupat per Aurora University.

Anàlisi del lideratge dels autors institucionals

Aquest treball s'ha realitzat amb col·laboració internacional, concretament amb investigadors de: Mexico.

Hi ha un lideratge significatiu, ja que alguns dels autors pertanyents a la institució apareixen com a primer o últim signant, es pot apreciar en el detall: Primer Autor (Fernández Bravo, Ana) i Últim Autor (Figueras Salvat, María Josefa).

l'autor responsable d'establir les tasques de correspondència ha estat Figueras Salvat, María Josefa.