{rfName}
AT

Indexat a

Llicència i ús

Icono OpenAccess

Citacions

2

Altmetrics

Grant support

No Statement Available

Anàlisi d'autories institucional

Serratosa FAutor o coautor

Compartir

10 dejuny de 2024
Publicacions
>
Article
Sí

ATENA: A Web-Based Tool for Modelling Metal Oxide Nanoparticles Based on NanoFingerprint Quantitative Structure-Activity Relationships

Publicat a:Molecules. 29 (10): 2235- - 2024-05-01 29(10), DOI: 10.3390/molecules29102235

Autors: Serratosa, Francesc

Afiliacions

Univ Rovira i Virgili, Comp Sci & Math Dept, Tarragona 43007, Catalonia, Spain - Autor o coautor

Resum

Modelling size-realistic nanomaterials to analyse some of their properties, such as toxicity, solubility, or electronic structure, is a current challenge in computational and theoretical chemistry. The representation of the all-atom three-dimensional structure of a nanocompound would be ideal, as it could account explicitly for structural effects. However, the use of the whole structure is tedious due to the high data management and the structural complexity that accompanies the surface of the nanoparticle. Developing appropriate tools that enable a quantitative analysis of the structure, as well as the selection of regions of interest such as the core-shell, is a crucial step toward enabling the efficient analysis and processing of model nanostructures. The aim of this study was twofold. First, we defined the NanoFingerprint, which is a representation of a nanocompound in the form of a vector based on its 3D structure. The local relationship between atoms, i.e., their coordination within successive layers of neighbours, allows the characterisation of the local structure through the atom connectivity, maintaining the information of the three-dimensional structure but increasing the management ability. Second, we present a web server, called ATENA, to generate NanoFingerprints and other tools based on the 3D structure of the nanocompounds. A case study is reported to show the validity of our new fingerprint tool and the usefulness of our server. The scientific community and also private companies have a new tool based on a public web server for exploring the toxicity of nanocompounds.

Paraules clau

Chemical 3d structureGraph embeddingGraph regressioGraph regressionMetal oxide nanocompoundNanofingerprint

Indicis de qualitat

Impacte bibliomètric. Anàlisi de la contribució i canal de difusió

El treball ha estat publicat a la revista Molecules a causa de la seva progressió i el bon impacte que ha aconseguit en els últims anys, segons l'agència Scopus (SJR), s'ha convertit en una referència en el seu camp. A l'any de publicació del treball, 2024 encara no hi ha indicis calculats, però el 2023, es trobava a la posició , aconseguint així situar-se com a revista Q1 (Primer Cuartil), en la categoria Pharmaceutical Science.

Independentment de l'impacte esperat determinat pel canal de difusió, és important destacar l'impacte real observat de la pròpia aportació.

Segons les diferents agències d'indexació, el nombre de citacions acumulades per aquesta publicació fins a la data 2025-07-23:

  • Scopus: 1

Impacte i visibilitat social

Des de la dimensió d'influència o adopció social, i prenent com a base les mètriques associades a les mencions i interaccions proporcionades per agències especialitzades en el càlcul de les denominades "Mètriques Alternatives o Socials", podem destacar a data 2025-07-23:

  • L'ús d'aquesta aportació en marcadors, bifurcacions de codi, afegits a llistes de favorits per a una lectura recurrent, així com visualitzacions generals, indica que algú està fent servir la publicació com a base del seu treball actual. Això pot ser un indicador destacat de futures cites més formals i acadèmiques. Aquesta afirmació està avalada pel resultat de l'indicador "Capture", que aporta un total de: 2 (PlumX).

Amb una intenció més de divulgació i orientada a audiències més generals, podem observar altres puntuacions més globals com:

    És fonamental presentar evidències que recolzin l'alineació plena amb els principis i directrius institucionals sobre Ciència Oberta i la Conservació i Difusió del Patrimoni Intel·lectual. Un clar exemple d'això és:

    • El treball s'ha enviat a una revista la política editorial de la qual permet la publicació en obert Open Access.

    Anàlisi del lideratge dels autors institucionals

    Hi ha un lideratge significatiu, ja que alguns dels autors pertanyents a la institució apareixen com a primer o últim signant, es pot apreciar en el detall: Primer Autor (Serratosa Casanelles, Francesc d'Assís) i Últim Autor (Alvarez-Puebla, Ramon A).

    l'autor responsable d'establir les tasques de correspondència ha estat Alvarez-Puebla, Ramon A.